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2023年6月29日 抗インフルエンザ剤感受性低下株調査の結果

結果の概要

2022/23シーズン中、2023年6月29日時点でインフルエンザ様疾患患者から採取された検体は以下の通りであった:

日本全国から、初診時248検体、再診時86検体、バロキサビル投与後54検体が採取された(表1)。

サイクリングプローブRT-PCR法によるPA/I38T変異の検出結果を以下に示す(表2)。

PA/I38T変異を有する患者の割合は以下の通りであった:

A(H1N1)pdm09では、3検体中、バロキサビル投与前後の検体でPA/I38T変異は検出されなかった(0.0%)。A(H3N2)では、バロキサビル投与前検体では224検体中1件(0.4%)からPA/I38T変異が検出された。投与後の検体では、53検体中4件(7.5%)でPA/I38T 変異が検出された。この頻度を再診時RT-PCR陽性検体に基づいて計算すると、19.0%(再診時RT-PCR陽性検体21件中、PA/I38T変異陽性が4件)となった。

亜型判定ができなかったインフルエンザAでは、投与前の検体9件中PA/I38T変異陽性は0件(0%)だった。

インフルエンザBは検出されなかった。

 

[PA遺伝子解析]

A(H3N2)では、次世代シークエンシング(NGS)により、バロキサビル投与後の臨床検体39件中、I38T変異が2件(5.1%)から検出された(表3)。

バロキサビル投与群でかつNGSに成功した再診時検体8件を分母とすると、PA変異の頻度は25%だった。

 

[NA遺伝子解析]

NGSでは、オセルタミビル投与前サンプル(0/126)および投与後サンプル(0/32)のいずれにおいても、ノイラミニダーゼ阻害薬に対する感受性を低下させるNA遺伝子の変異は認められなかった(表4)。

Summary of Results.
During 2022/23 season, samples collected from influenza-like-illness patients as of June 29, 2023 were as below:

From main island of Japan and Okinawa 248 samples were collected at the first visit, 86 samples at the second visit, 54 samples after baloxavir treatment (Table 1).

 

The results of the detection of PA/I38T substation by cycling probe real-time PCR are shown below (Table 2).

The percentage of patients with PA/I38T substitution was:
In A(H1N1)pdm09, no PA/I38T variant in pre- and post-treatment samples was detected out of 3 samples (0.0%). In A(H3N2), among pre-treatment samples 1 PA/I38T variant (0.4%) was detected out of 224 samples. Among post baloxavir-treatment samples, 4 PA/I38T variants (7.5%) were detected out of 53 samples. If the frequency is calculated based on RT-PCR-positives at the second visit, it became 19.0% (4 PA/I38T variants out of 21 RT-PCR-positive samples at the second visit).

In unsubtyped influenza A, pre-treatment samples were 0 positive (0%) PA/I38T variant out of 9 specimens.

Influenza B was not detected.

 

[PA gene analysis]

In A(H3N2), two I38T substitutions (5.1%) out of 39 paired baloxavir-treated clinical sample was detected by next-generation sequencing (Table 3). If the denominator is based on 8 samples with successful NGS in the baloxavir-treated group, the frequency of PA variant was 25%.

 

[NA gene analysis]

No substitution in NA gene which confer reduced sensitivity to NAIs was found by next-generation sequencing either in pre-treatment samples (0/126) or post-oseltamivir-treated samples (0/32) (Table 4).