ブログ|Blog

2023年3月23日 抗インフルエンザ剤感受性低下株調査の結果

2022/23年シーズン 抗インフルエンザ剤感受性低下株調査の結果
新潟大学大学院医歯学総合研究科・国際保健

結果の概要

2023 年 3 月 22 日の時点で、2022/23 シーズン中にインフルエンザ様疾患の患者から採取されたサンプルは以下のとおりです。

初診時検体が155件、再診時検体が37件、バロキサビル投与後検体が19件収集されました(表1)。

サイクリング プローブ リアルタイム PCR による PA/I38T 変異ありの検出結果を以下に示します (表 2)。

PA/I38T変異があった症例の割合は次のとおりです。

A(H1N1)pdm09 では、1 件中、バロキサビル投与前及び後のサンプルで PA/I38T 変異は検出されませんでした (0.0%)。 A(H3N2) では、投与前のサンプルのうち、136件中 1 件(0.7%)でPA/I38変異が検出されました。 投与後のサンプルでは、PA/I38T 変異が18 件中 1 件(5.5%) で、 I38&I38T変異の混合が18件中1件 (5.5%) で検出されました。 再診時かつRT-PCR 陽性となった検体を母集団として頻度を計算した場合、 8 件中 PA/I38T 変異が1件(12.5%) で、I38&I38T変異が1件 (12.5%) で検出されました。

サブタイプが判定できなかったA型インフルエンザのうち、バロキサビル投与前の検体7件では、PA/I38T変異は検出されませんでした。

インフルエンザ B は検出されませんでした。

【PA遺伝子解析】

A(H3N2) では、13 例のバロキサビル投与後臨床サンプルのうち 、1 件(7.6%)で PA/I38M 置換が次世代シーケンシングによって検出されました (表 3)。このサンプルはサイクリングプローブでI38とI38T変異株の混合として検出されたのですが、次世代シークエンスの結果はPA/I38M変異でした。PA変異株の頻度をバロキサビル投与後に次世代シークエンス解析ができた2サンプルを分母として計算すると、PA変異株の頻度は50.0%でした 。

【NA遺伝子解析】

A(H3N2)において、ノイラミニダーゼ阻害薬(NAI)に対する感受性を低下させるNA変異株は、投与前の検体でも(0/53)、オセルタミビル投与後の検体からも(0/25)、次世代シーケンシングによって検出されませんでした(表4)。

Summary of Results.
During 2022/23 season, samples collected from influenza-like-illness patients as of March 22, 2023 were as below:

155 samples collected at the first visit, 37 samples at the second visit, 19 samples after baloxavir treatment (Table 1).

The results of the detection of PA/I38T substation by cycling probe real-time PCR are shown below (Table 2).

The percentage of patients with PA/I38T substitution was:
In A(H1N1)pdm09, no PA/I38T variant in pre- and post-treatment samples was detected out of 1 sample (0.0%). In A(H3N2), among pre-treatment samples 1 PA/I38T variant (0.7%) was detected out of 136 samples. Among post baloxavir-treatment samples, 1 PA/I38T variant (5.5%) and 1 mixed I38&I38T (5.5%) were detected out of 18 samples. If the frequency is calculated based on RT-PCR-positives at the second visit, 1 PA/I38T variant (12.5%) and 1 mixed I38&I38T (12.5%) were detected out of 8 RT-PCR-positive samples at the second visit.

In unsubtyped influenza A, pre-treatment samples were 0 positive (0%) PA/I38T variant out of 7 specimens.

Influenza B was not detected.

 

[PA gene analysis]

In A(H3N2), one PA/I38M substitution (7.6%) out of 13 paired baloxavir-treated clinical sample was detected by next-generation sequencing (Table 3). This case was identified as mixed I38&I38T by the cycling probe RT-PCR assay but it turned out to be PA/I38M by NGS. If the denominator is based on 2 samples with successful NGS in the baloxavir-treated group, the frequency of PA variant was 50.0%

 

[NA gene analysis]

No substitution in NA gene which confer reduced sensitivity to NAIs was found by next-generation sequencing either in pre-treatment samples (0/53) or oseltamivir treated samples (0/25) (Table 4).